Identificación de proteínas en Candidatus Liberibacter asiaticus para desarrollar un método de detección inmunoenzimático

Autores/as

  • Cynthia Guadalupe Rodríguez-Quibrera Campo Experimental Ixtacuaco-INIFAP. Carretera Martínez de la Torre-Tlapacoyan km 4.5, col. Rojo Gómez, Tlapacoyan, Veracruz. CP. 93600. Tel. 800 0882222, ext. 87601.
  • Isidro Humberto Almeyda-León Campo Experimental General Terán-NIFAP. Carretera Montemorelos-China km 31, col. Ex Hacienda Las Anacuas, General Terán, Nuevo León, México. CP. 67400. Tel. 55 38718700, ext. 83615
  • Felipe Roberto Flores de la Rosa Campo Experimental Ixtacuaco-INIFAP. Carretera Martínez de la Torre-Tlapacoyan km 4.5, col. Rojo Gómez, Tlapacoyan, Veracruz. CP. 93600. Tel. 800 0882222, ext. 87601
  • José Luis Hernández-Mendoza Centro de Biotecnología Genómica-Instituto Politécnico Nacional. Boulevard del Maestro s/n, esq. Elías Piña, col. Narciso Mendoza, Ciudad Reynosa, Tamaulipas, México. CP. 88710. Tel. 55 57296300, ext. 87714
  • María Antonia Cruz-Hernández Centro de Biotecnología Genómica-Instituto Politécnico Nacional. Boulevard del Maestro s/n, esq. Elías Piña, col. Narciso Mendoza, Ciudad Reynosa, Tamaulipas, México. CP. 88710. Tel. 55 57296300, ext. 87714
  • Alberto Mendoza-Herrera Centro de Biotecnología Genómica-Instituto Politécnico Nacional. Boulevard del Maestro s/n, esq. Elías Piña, col. Narciso Mendoza, Ciudad Reynosa, Tamaulipas, México. CP. 88710. Tel. 55 57296300, ext. 87714

DOI:

https://doi.org/10.29312/remexca.v13i8.3355

Palabras clave:

diagnóstico, huanglongbing, serología

Resumen

El objetivo de este trabajo fue identificar en el genoma de Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), proteínas de membrana externa con potencial para el desarrollo y optimización de un método de detección inmunoenzimático. El estudio se realizó durante 2019 y se utilizó el servidor web Predict Protein, así como las bases de datos HhPred/HhSearch y Pfam. Se detectaron 52 proteínas de membrana externa en el genoma completo de CLas, de las cuales, 11 no habían sido caracterizadas previamente. Los análisis predictivos realizados en la proteína B8Y674 generaron ocho posibles epítopos y cuatro de ellos evaluados experimentalmente en células B, mostraron porcentajes de identidad entre 80 a 90%. Se detectó a CLas mediante PCR-punto final a partir del ADN extraído de limón mexicano con síntomas de Huanglongbing utilizando iniciadores diseñados sobre la secuencia del gen Omp que codifica para la proteína B8Y674 y se registró 95% de identidad entre las secuencias generadas y secuencias de CLas previamente reportadas. Los resultados obtenidos nos permiten inferir que la proteína B8Y674 es un candidato potencial para ser utilizada en la detección inmunoenzimática de CLas.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

Achor, D. S.; Welker, S.; Ben-Mahmoud, S.; Wang, C.; Folimonova. S. Y.; Dutt, M.; Gowda, S. and Levy, A. 2020. Dynamics of Candidatus Liberibacter asiaticus movement and sieve pore plugging in citrus sink cells. Plant Physiol. 182(2):882-891. Doi: 10.1104/pp.19.01391.

Andrade, M. O.; Pang, Z.; Achor, D. S.; Wang, H.; Yao, T.; Singer, B. H. and Wang, N. 2020. The flagella of “Candidatus Liberibacter asiaticus” and its movement in planta. Molecular plant pathology. 21(1):109-123. Doi: 10.1111/mpp.12884.

Bastianel, C.; Garnier-Semancik, M.; Renaudin, J.; Bové, J. M. and Eveillard, S. 2005. Diversity of “Candidatus Liberibacter asiaticus,” based on the omp gene sequence. Appl. Environ. Microbiol. 71(11):6473-6478. Doi: 10.1128/AEM.71.11.6473-6478.2005.

Carrizo, A.; Brihuega, B.; Etchechoury, I.; Arese, A.; Romero, S.; Gioffré, A., Romano, M. F. and Caimi, K. 2009. Identification of immunoreactive antigens of Leptospira interrogans. Rev. Argentina de Microbiol. 41(3):129-133.

Chen, J.; Deng, X.; Sun, X.; Jones, D.; Irey, M. and Civerolo, E. 2010. Guangdong and Florida populations of ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ distinguished by a genomic locus with short tandem repeats. Phytopathology. 100(6):567-572. Doi: 10.1094/PHYTO-100-6-0567.

Conesa, A.; Gotz, S.; García-Gómez. J. M.; Terol, J.; Talón, M. and Robles, M. 2005. Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research. Bioinformatics. 21(18):3674-3676.

Ding, F.; Duan, Y.; Paul, C.; Brlansky, R. H. and Hartung, J. S. 2015. Localization and Distribution of “Candidatus Liberibacter asiaticus” in citrus and periwinkle by direct tissue blot immuno assay with an anti ompa polyclonal antibody. Plos One. 10(5):e0123939-10. http://doi.org/ 10.1371/journal.pone.0123939.

Fundora, H. H.; Puig, P. Y.; Chiroles, R. S.; Rodríguez, B. A. M.; Gallardo, D. J. y Milián, S. Y. 2013. Métodos inmunológicos utilizados en la identificación rápida de bacterias y protozoarios en aguas. Rev. Cubana de Hig. Epidemiol. 51(1):84-96.

Lin, H.; Han, C. S.; Liu, B.; Lou, B.; Bai, X.; Deng, C.; Civerolo, E. L. and Gupta, G. 2013. Complete genome sequence of a chinese strain of “Candidatus Liberibacter asiaticus”. Genome Announcements. 1(2):e00184-13. Doi: 10.1128/genomeA.00184-13.

Lu, L.; Cheng, B.; Yao, J.; Peng, A.; Du, D.; Fan, G.; Hu, X.; Zhang, L. and Chen, G. 2013. A new diagnostic system for detection of ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ infection in citrus. Plant Dis. 97(10):1295-1300. http://dx.doi.org/10.1094/ PDIS-11-12-1086-RE.

Mauri, C. and Bosma, A. 2012. Immune regulatory function of b cells. Annual Review of Immunol. 30:221-242. Doi: 10.1146/annurev-immunol-020711-074934.

McCollum, G.; Hilf, M.; Irey, M.; Luo, W. and Gottwald, T. 2016. Susceptibility of sixteen citrus genotypes to ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’. Plant Dis. 100(6):1080-1086. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-08-15-0940-RE.

Rodríguez, Q. C. G.; Alanís, M. E. I.; Velázquez, M. J. J. y Almeyda, L. I. H. 2010. Optimización de la técnica de extracción del DNA de plantas de cítricos para el diagnóstico del HLB. En 1er. simposio nacional sobre investigación para el manejo del psílido asiático de los cítricos y el huanglongbing en México. Monterrey, Nuevo León. 22-29 pp.

Rodríguez, Q. C. G.; Almeyda, L. I. H.; Alvarez, O. M. G.; Hernández, G. C. y Mendoza, H. A. 2018. Detección de Candidatus liberibacter asiaticus mediante PCR-punto final, utilizando iniciadores diseñados a partir de los genes omp y clibasia-02425. In: memoria del XXX1 Simposio de avances en Investigación Agrícola, Pecuaria, Forestal, Acuícola, Pesquería, Desarrollo Rural, Transferencia de Tecnología, Biotecnología, Ambiente, Recursos Naturales y Cambio Climático. Veracruz. 1644-1655 pp.

Söding, J.; Biegert, A. and Lupas, A. N. 2005. The HHpred interactive server for protein homology detection and structure prediction. Nucleic Acids Res. 33(2):244-248. Doi: 10.1093/nar/ gki408.

Tomimura, K.; Miyata, S.; Furuya, N.; Kubota, K.; Okuda, M.; Subandiyah, S.; Hung, T.; Su, H. J. and Iwanami, T. 2009. Evaluation of genetic diversity among ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ isolates collected in southeast Asia. Phytopathology. 99(9):1062-1069. Doi: 10.1094/PHYTO-99-9-1062.

Yuan, Q.; Jordan, R.; Brlansky, R. H.; Minenkova, O. and Hartung, J. 2016. Development of single chain variable fragment (scFv) antibodies against surface proteins of ‘Ca. Liberibacter asiaticus’. J. Microbiol. Methods. 122:1-7. Doi: 10.1016/j.mimet.2015.12.015.

Zherdev, A. V.; Vinogradova, S. V.; Byzova, N. A.; Porotikova, E. V.; Kamionskaya, A. M. and Dzantiev, B. B. 2018. Methods for the diagnosis of grapevine viral infections: a review. Agriculture. 8(12):1-19. Doi: 10.3390/agriculture8120195.

Publicado

2022-12-13

Cómo citar

Rodríguez-Quibrera, Cynthia Guadalupe, Isidro Humberto Almeyda-León, Felipe Roberto Flores de la Rosa, José Luis Hernández-Mendoza, María Antonia Cruz-Hernández, y Alberto Mendoza-Herrera. 2022. «Identificación De proteínas En Candidatus Liberibacter Asiaticus Para Desarrollar Un método De detección inmunoenzimático». Revista Mexicana De Ciencias Agrícolas 13 (8). México, ME:1489-94. https://doi.org/10.29312/remexca.v13i8.3355.

Número

Sección

Nota de investigación

Artículos más leídos del mismo autor/a