Variabilidad genotípica de aislados de Phytophthora capsici en Guanajuato

Autores/as

  • Brenda Zulema Guerrero-Aguilar Centro de Investigación Regional del Centro-INIFAP. Carretera Celaya-San Miguel de Allende km 6.5, Celaya, Guanajuato, México. CP. 38124
  • José Luis Pons-Hernández Centro de Investigación Regional del Centro-INIFAP. Carretera Celaya-San Miguel de Allende km 6.5, Celaya, Guanajuato, México. CP. 38124
  • Mario Martin González-Chavira Centro de Investigación Regional del Centro-INIFAP. Carretera Celaya-San Miguel de Allende km 6.5, Celaya, Guanajuato, México. CP. 38124
  • Enrique González-Pérez Centro de Investigación Regional del Centro-INIFAP. Carretera Celaya-San Miguel de Allende km 6.5, Celaya, Guanajuato, México. CP. 38124.
  • Salvador Villalobos-Reyes Centro de Investigación Regional del Centro-INIFAP. Carretera Celaya-San Miguel de Allende km 6.5, Celaya, Guanajuato, México. CP. 38124.
  • Raúl Rodríguez Guerra Centro de Investigación Regional del Noreste-INIFAP. Carretera Matamoros Reynosa km 61, Col. Zona Rural Rio Bravo, Rio Bravo, Tamaulipas, México. CP. 88900

DOI:

https://doi.org/10.29312/remexca.v13i1.2982

Palabras clave:

Diversidad poblaciona, marchitez del chile, Variación genética

Resumen

Phytophthora capsici, es el agente causal de la ‘marchitez del chile’ una de las enfermedades más importantes de este cultivo. Para establecer estrategias de control eficientes es necesario el conocimiento de la diversidad del patógeno, para esto, se realizó esta investigación cuyo objetivo fue determinar el grado de diversidad genética de 30 aislados monozoospóricos obtenidos de chile (Capsicum annuum L.) de seis municipios del estado de Guanajuato, y dos cepas de referencia. La variación genética se determinó mediante la técnica de AFLP (en español: polimorfismo en la longitud de fragmentos amplificados). La similitud encontrada entre los aislados va de 76 a 95%. Los resultados obtenidos indican que dentro de la población se forman grupo basados en las localidades de aislamiento. No se encontraron organismos clónales por lo que los 32 aislamientos analizados fueron genotipos únicos, y no se encontró ninguna correlación entre grupos definidos por marcadores moleculares y virulencia, tipo de apareamiento o respuesta a metalaxil.

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Citas

Abu-El Samen, F. M.; Secor, G. A. and Gudmestad, N. C. 2003. Genetic variation among asexual progeny of Phytophthora infestans detected with RAPD and AFLP markers. Plant Pathol. 52(3):314-325. https://doi.org/10.1046/j.1365-3059.2003.00858.x.

Brasier, C. M. and Hansen, E. 1992. Evolutionary biology of Phytophthora Part II: phylogeny, speciation, and population structure. Annual Rev. Phytopathol. 30(1):173-200. https://doi.org/10.1146/annurev.py.30.090192.001133.

Castro-Rocha, A.; Shrestha, S.; Lyon, B.; Grimaldo-Pantoja, G. L.; Flores-Marges, J. P.; Valero-Galván, J.; Aguirre-Ramírez, M.; Osuna-Ávila, P.; Gómez-Dorantes, N.; Ávila-Quezada, G.; Luna-Ruíz, J. J.; Rodríguez-Alvarado, G.; Fernández-Pavía, S. P. and Lamour, K. 2016. An initial assessment of genetic diversity for Phytophthora capsici in northern and central Mexico. Mycol Progress. 15(2):1-12. Doi 10.1007/s11557-016-1157-0.

Cavalli-Sforza, L. L. y Bodmer, W. F. 1981. Genética de las poblaciones humanas. (Ed.). Omega, Barcelona. 124-126 pp.

Doyle, J. J. and Doyle, J. L. 1987. A rapid DNA isolation procedure from small quantities of fresh leaf tissues. Phytochem. Bulletin. 19(1):11-15. http://irc.igd.cornell.edu/protocols/Doyle Protocol.pdf.

Erwin, D. C. and Ribeiro, O. K. 1996. Phytophthora Diseases Worldwide. APS PRESS. The American Phytopathological Society. St. Paul, Minnesota. 562 p.

Gevens, A. J.; Donahoo, R. S.; Lamour, K. H. and Hausbeck, M. K. 2008. Characterization of Phytophthora capsici causing foliar and pod blight of snap bean in Michigan. Plant Dis. 92(2):201-209. Doi:10.1094/PDIS-92-2-0201.

Gobena, D.; Roig, J.; Galmarini, C.; Hulvey, J. and Lamour, K. H. 2012. Genetic diversity of Phytophthora capsici isolates from pepper and pumpkin in Argentina. Mycologia. 104(1):102-107. Doi:10.3852/11-147.

Goodwin, S. B. 1997. The population genetics of Phytophthora. Phytopathology. 87(4):462-473. Doi: 10.1094/PHYTO.1997.87.4.462.

González-Pérez, E.; Yáñez-Morales, M.; Santiago-Santiago, V. y Montero-Pineda, A. 2004. Biodiversidad fungosa en la marchitez del chile y algunos factores involucrados, en Tlacotepec de José Manzo, El Verde, Puebla. Agrociencia. 38(6):653-661. http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=30238609.

Granke, L. L.; Windstam, S. T.; Hoch, H. C.; Smart, C. D. and Hausbeck, M. K. 2009. Dispersal and movement mechanisms of Phytophthora capsici sporangia. Phytopathology. 99(11):1258-1264. https://doi.org/10.1094/Phyto-99-11-1258.

Granke, L. L.; Quesada-Ocampo, L. and Lamour, K. 2012. Advances in research on Phytophthora capsici on vegetable crops in the United States. Plant Dis. 95(11):1588-1600. https://doi.org/10.1094/PDIS-03-11-0190.

Gupta, P. K.; Varshney, R. K.; Sharma, P. C. and Ramesh, B. 1999. Molecular markers and their applications in wheat breeding. Plant Breed. 118(5):369-390. https://doi.org/10.1046/ j.1439-0523.1999.00401.x.

Hausbeck, M. K. and Lamour, K. H. 2004. Phytophthora capsici on vegetable crops: research progress and management challenges. Plant Dis. 88(12):1292-1303. https://doi.org/ 10.1094 /PDIS.2004.88.12.1292.

Hurtado-Gonzáles, O.; Aragón-Caballero, L.; Apaza-Tapia, W.; Donahoo, R. and Lamour, K. 2008. Survival and spread of Phytophthora capsici in Coastal Peru. Phytopathology. 98(6):688-694. https://doi.org/10.1094/Phyto-98-6-0688.

INEGI. 2013. Instituto Nacional de Estadística y Geografía. Conociendo Guanajuato. Aguascalientes, Aguascalientes. México. Serie Conociendo México. Folleto informativo. 30 p.

Kersey, R.; Sanogo, S.; Carpenter, J. and Bosland, P. 2005. Determination of genetic diversity of Phytophthora capsici isolates in New Mexico with AFLP Markers. in Plant & Animal Genomes XIII Conference. 15-19 pp.

Lamour, K. H. and Hausbeck, M. K. 2001a. The dynamics of mefenoxam insensitivity in a recombining population of Phytophthora capsici characterized with amplified fragment length polymorphism markers. Phytopathology. 91(6):553-557. https://doi.org/10.1094/ Phyto.2001.91.6.553.

Lamour, K. H. and Hausbeck, M. K. 2001b. Investigating the spatiotemporal genetic structure of Phytophthora capsici in Michigan. Phytopathology. 91(10):973-980. https://doi.org/10. 1094/PHYTO.2001.91.10.973.

Lamour, K. H.; Stam, R.; Jupe, J. and Huitema, E. 2011. The oomycete broad-host-range pathogen Phytophthora capsici. Mol. Plant Pathol. 13(4):329-337. Doi: 10.1111/j.1364-3703.2011.00754.x.

Lamour, K.; Mudge, J.; Gobena, D.; Hurtado-Gonzáles, O.; Shmutz, J.; Kuo, A.; Miller, N. A.; Rice, B. J.; Raffaele, S.; Cano, L. M.; Bharti, A. K.; Donahoo, R. S.; Finley, S.; Huitema, E.; Hulvey, J.; Platt, D.; Salamov, A.; Savidor, A.; Sharma, R.; Stam, R.; Storey, D.; Thines, M.; Win, J.; Haas, B. J.; Dinwiddie, D. L.; Jenkins, J.; Knight, J. R.; Affourtit, J. P.; Han, C. S.; Chertkov, O.; Lindquist, E. A.; Detter, C.; Grigoriev, I. V.; Kamoun, S. and Kingsmore, S. K. 2012. Genome sequencing and mapping reveal loss of heterozygosity as a mechanism for rapid adaptation in the vegetable pathogen Phytophthora capsici. Mol. Plant-Microbe Interact. 25(10):1350-1360. Doi:10.1094/MPMI-02-12-0028-R.

Lebreton, L. and Andrivon, D. 1998. French isolates of Phytophthora infestans from potato and tomato differ in phenotype and genotype. Eur. J. Plant Pathol. 104(6):583-594. Doi:10.1023/A:1008662518345.

Martin, F. N.; Abad, Z. G.; Balci, Y. and Ivors, K. 2012. Identification and Detection of Phytophthora: Reviewing Our Progress, Identifying Our Needs. Plant Dis. 96(8):1080-1103. https://doi.org/10.1094/PDIS-12-11-1036-FE.

Mahuku, G.; Peters, R. D.; Platt, H. W. and Daayf, F. 2000. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of Phytophthora infectants isolates collected in Canada during 1994 to 1996. Plant Pathol. 49(2):252-260. https://doi.org/10.1046/j.1365-3059.2000.00450.x.

McDonald, B. A. and Linde, C. 2002. Pathogen population genetics, evolutionary potential, and durable resistance. Annu. Rev. Phytopathol. 40(1):349-379. https://doi.org/10.1146/ annurev.phyto.40.120501.101443.

Meitz, J. C.; Linde, C. C.; Thompson, A.; Langenhoven, S. and McLeod, A. 2010. Phytophthora capsici on vegetable hosts in South Africa: distribution, host range and genetic diversity. Australasia Plant Path. 39(5):431-439. https://doi.org/10.1071/AP09075.

Mitchell, D. J. and Kannwischer-Mitchell, M. E. 1995. Genetic, biochemical, and molecular techniques for the identification and detection of soilborne plant-pathogenic fungi. In: methods for research on soilborne phytopathogenic fungi. (Ed.). Singleton, L. L.; Mihail, J. D. and Crush, M. APS Press., USA. 95-98 pp.

Mohammadi, S. A. and Prasanna, B. M. 2003 Review and interpretation analysis of genetic diversity in crop plants-salient statistical tools. Crop Sci. 43(4):1235-1248. https://doi.org/10.2135/cropsci2003.1235.

Núñez-Colín, C. A. y Valadez-Moctezuma, E. 2010. Análisis estadístico de huellas genómicas. Un uso práctico de los paquetes computacionales más populares. INIFAP, Celaya, Guanajuato, México. 103 p.

Parada-Rojas, C. H. and Quesada-Ocampo, L. M. 2018. Analysis of microsatellites from transcriptome sequences of Phytophthora capsici and applications for population studies. Scientific Reports. 8(5194):1-12. https://doi.org/10.1038/s41598-018-23438-8.

Pons, H. J. L.; Guerrero-Aguilar, B. Z.; González-Chavira, M. M.; González-Pérez, E.; Villalobos-Reyes, S. y Muñoz-Sánchez, C. I. 2020. Variabilidad fenotípica de aislados de Phytophthora capsici en Guanajuato. Rev. Mex. Cienc. Agríc. 11(8):1891-1901. https://doi.org/10.29312/remexca.v11i8.2618.

Quesada-Ocampo, L. M.; Granke, L. L.; Mercier, M. R.; Olsen, J. and Hausbeck, M. K. 2011. Investigating the genetic structure of Phytophthora capsici populations. Phytopathology. 101(9):1061-1073. Doi: 10.1094/Phyto-11-10-0325.

Rohlf, F. J. 2005. NTSYSpc: numeral taxonomy and multivariate analysis system. Ver. 2.2. Exeter Software. Setauket, USA. 42 p.

Sneath, P. H. A. and Sokal, R. R. 1973. Numerical taxonomy-the principle and practice of numerical classification. Freeman, W. H. and Co., San Francisco. https://doi.org/10.2307 /2412767.

Universidad Illinois. 2001. Phytophthora blight of pepper. Report on plant disease. Department of crop sciences, University of Illinois at Urbana-Champaign. RPD. 947 p. http://web.aces.uiuc.edu/vista/pdf-pubs/947.pdf.

Vos, P.; Hogers, R.; Bleeker, M.; Reijans, M.; Van der Lee, T.; Hornes, M.; Frijters, A.; Pot, J.; Peleman, J.; Kulper, M. and Zabeau, M. 1995. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Res. 23(1):4407-4414. Doi: 10.1093/nar/23.21.4407.

Publicado

2022-02-08

Cómo citar

Guerrero-Aguilar, Brenda Zulema, José Luis Pons-Hernández, Mario Martin González-Chavira, Enrique González-Pérez, Salvador Villalobos-Reyes, y Raúl Rodríguez Guerra. 2022. «Variabilidad genotípica De Aislados De Phytophthora Capsici En Guanajuato». Revista Mexicana De Ciencias Agrícolas 13 (1). México, ME:181-90. https://doi.org/10.29312/remexca.v13i1.2982.

Número

Sección

Nota de investigación

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